Το Mortal Kombat 11 έχει πολλούς νέους και επιστρέφοντες μαχητές, αλλά λόγω γεγονότων ιστορίας και άλλων λόγων, ορισμένοι χαρακτήρες του MKX δεν επέστρεψαν.
Ο κύριος ανταγωνιστής του Mortal Kombat X, ο Shinnok, είναι ένας ισχυρός Πρεσβύτερος Θεός που επιδιώκει να ράψει την καταστροφή στα βασίλεια. Ο Ρέιντεν διαταράσσει τα σχέδια του Κρόνικα αποκεφαλίζοντας τον Σίνοκ, ανατρέποντάς τον οριστικά. Οι δεξιότητες του Shinnok ως μάγου ταιριάζουν μόνο με τον δαίμονα Quan Chi που προσπάθησε να απελευθερώσει τον Shinnok από τη φυλάκιση στην ιστορία του Mortal Kombat X. Κατά τη διάρκεια αυτού, ο Scorpion μαθαίνει ότι ο Quan Chi είναι υπεύθυνος για τη δολοφονία της φυλής και της οικογένειάς του και τον αποκεφάλισε ως εκδίκηση. Ο Kenshi βλέπει αυτό και την απόδραση του Shinnok από τη φυλάκιση, αλλά παθαίνει νοκ άουτ και δεν τον ξαναδούν μέχρι το Mortal Kombat 11.
Στο Mortal Kombat 11 Krypt, οι παίκτες μπορούν να βρουν το νεκρό σώμα του Kenshi και τα κόκκινα μάτια του που επιτρέπουν να φαίνονται τα πνεύματα. Επίσης στο Krypt βρίσκεται το τετράπτυχο Shokan, Goro. Το σώμα του βρίσκεται στο τμήμα Goro’s Lair της Κρύπτης. Στο προηγούμενο παιχνίδι, ο Ferra/Torr ήταν ένας αγαπημένος μαχητής από τους θαυμαστές παρόλο που δεν είχε μεγάλο ρόλο στην ιστορία. Μια αλληλεπίδραση μεταξύ του Kollector και του D’Vorah στο Mortal Kombat 11 έχει τον τελευταίο να ισχυρίζεται ότι έχει βρει και τα δύο σώματά τους. Εάν πιστεύεται, τότε είτε το δίδυμο πέθανε από άγνωστα αίτια είτε η ίδια η D’Vorah. Ένας από τους παλαιότερους μαχητές, ο Ermac, δεν εμφανίζεται στο Mortal Kombat 11. Μετά την ήττα του Shinnok, η τρέχουσα κατάστασή του είναι ακόμα άγνωστη.
Cameo Fighters
Υπάρχουν τρεις μαχητές στο Mortal Kombat X οι οποίοι, αν και δεν μπορούν να παιχτούν στο MK11, έχουν ακόμα μικρά cameo. Ο Takeda Takahashi εθεάθη τελευταία φορά να κρατιέται χέρι-χέρι με τον νεοφερμένο Jacqui Briggs στο Mortal Kombat X. Αποκαλύφθηκε ότι το ζευγάρι έχει παντρευτεί στο διάστημα μεταξύ των αγώνων, αντιπροσωπεύοντας ένα σπάνιο αίσιο τέλος για τη σειρά. Ένας άλλος μαχητής καμέο είναι ο Kung Jin που κάνει την εμφάνισή του σε πολλούς τροποποιητές πύργων και ανοίγοντας διαλόγους μάχης. Τελευταίο αλλά όχι λιγότερο σημαντικό είναι το αγαπημένο Reptile, που πολλοί ήλπιζαν σε ένα Kombat Pack. Αυτή τη στιγμή είναι ζωντανός όπως φαίνεται στη λειτουργία Krypt. Υπάρχουν επίσης αρκετές αναφορές σε αυτόν, όπως η ικανότητα slide του Shang Tsung και τα εναλλακτικά skins του Scorpion.
Κάθε μαχητής DLC για το Mortal Kombat X επίσης δεν εμφανίζεται στο MK11. Αυτό δεν προκαλεί έκπληξη δεδομένου ότι αυτά τα μαχητικά είναι πάντα άσχετα με την ιστορία και πολύ περισσότερο είναι απλώς τρόποι. για να πειραματιστούν τα Netherrealm Studios. Το αν κάποιος από τους προαναφερθέντες μαχητές θα επιστρέψει με κάποιο τρόπο από τους νεκρούς ή θα κάνει άλλη μια εμφάνιση ως πλήρης μαχητής μένει να φανεί. Το στούντιο φέρεται να εργάζεται στο Mortal Kombat 12 αντί του υποτιθέμενου Injustice 3, οπότε οι θαυμαστές της σειράς μπορεί να μην χρειαστεί να περιμένουν τόσο πολύ όσο την τελευταία φορά για να το μάθουν.
Το Mortal Kombat 12 φημολογείται ότι βρίσκεται σε εξέλιξη.