ל- Mortal Kombat 11 יש הרבה לוחמים חדשים וחוזרים, אבל בגלל אירועי סיפור וסיבות אחרות, חלק מדמויות MKX לא חזרו.
האנטגוניסט העיקרי של Mortal Kombat X, Shinok, הוא אל מבוגר רב עוצמה המבקש לתפור הרס ברחבי הממלכות. ריידן משבש את תוכניותיו של קרוניקה על ידי עריפת ראשו של שינוק, ומבטל את יכולתו לצמיתות. כישוריו של שינוק כמכשף תואמים רק השד קואן צ'י שביקש לשחרר את שינוק מהכלא בתוך הסיפור מורטל קומבט X. במהלך זה, סקורפיון לומד שקוואן צ'י אחראי לרצח שבט ומשפחתו וערף את ראשו כנקמה. קנשי רואה את זה ואת הבריחה של שינוק מהכלא, אבל נדפק ולא נראה שוב עד מורטל קומבט 11.
בMortal Kombat 11's Krypt, שחקנים יכולים למצוא את גופתו של קנשי ואת כיסוי העיניים האדום שלו המאפשר לראות רוחות. כמו כן בקריפט שוקן ארבע זרועות, גורו. ניתן למצוא את גופתו בחלק המאורה של גורו של הקרפט. במשחק הקודם, Ferra/Torr היה לוחם אהוב על מעריצים למרות שלא היה לו תפקיד סיפור גדול. אינטראקציה בין קולקטור וד'בורה במורטל קומבט 11 טוענת שהאחרונים מצאו את גופותיהם. אם מאמינים, אז או שהצמד מת מסיבות לא ידועות או ד'בורה עצמה. אחד הלוחמים הוותיקים ביותר, ארמק, לא מופיע במורטל קומבט 11. לאחר תבוסתו של שינוק, מעמדו הנוכחי עדיין לא ידוע.
קמיאו פייטרס
ישנם שלושה לוחמים במורטל קומבט X שלמרות שלא ניתן לשחק בהם ב-MK11, עדיין יש להם קמיעות קטנות. Takeda Takahashi נראה לאחרונה מחזיק ידיים עם העולה החדשה ג'קי בריגס במורטל קומבט X. נחשף שהזוג התחתן בזמן שבין המשחקים, מה שמהווה סוף טוב נדיר לסדרה. לוחם קמיע נוסף הוא קונג ג'ין שמופיע בכמה מתקנים מגדלים ופותח דיאלוגים של קרב. אחרון חביב הוא הזוחל האהוב, שרבים קיוו לו בחבילת קומבט. הוא חי כרגע כפי שנראה במצב Krypt. יש גם כמה התייחסויות אליו, כמו יכולת ההחלקה של שאנג טסונג והעורות החלופיים של סקורפיון.
כל לוחם DLC בודד עבור Mortal Kombat X גם לא מופיע בMK11. זה לא מפתיע בהתחשב בכך שהלוחמים האלה תמיד לא קשורים לסיפור ויותר מכך הם רק דרכים לאולפני Netherrealm להתנסות. האם מישהו מהלוחמים הנ"ל יחזור איכשהו מהמתים או יופיע שוב כלוחם מן המניין נותר לראות. על פי הדיווחים, האולפן עובד על Mortal Kombat 12 במקום על Injustice 3 המשוער, כך שמעריצי הסדרה לא יצטרכו לחכות זמן רב כמו בפעם הקודמת כדי לגלות זאת.
לפי השמועות Mortal Kombat 12 נמצא בפיתוח.