Er zijn niet zoveel Pokemon in Ruins of Remembrance als in sommige andere cursussen van New Pokemon Snap, maar er zijn een of twee goede.

Onderzoeksniveau 1

• Houndoom – Houndoom verschijnt direct aan het begin van de baan en loopt met de speler naar het ondergrondse gedeelte. Er zijn ook meer beneden in de ruïnes, zowel bij de ingang als waar spelers het eerst onderaan aankomen.
• Eldegoss – Er zweven wat Eldegoss rond in het openingsgedeelte van de cursus. Er zijn er meer beneden in de ruïnes in de buurt van een Crystabloom, evenals een die bij een van de zes standbeelden hangt.
• Salandit – Spelers zullen Salandit voor het eerst zien nadat ze door het gat in de grond zijn gegaan dat naar de ruïnes leidt. Het verschijnt aan de linkerkant net voor een kleine stenen put.
• Noivern – Noivern zal de spelers komen begroeten net voordat ze de hoofdgrot betreden die de ruïnes herbergt. Er glijden er ook een of twee rond in de grot op hogere onderzoeksniveaus.
• Sigilyph – Er zijn verschillende Sigilyphs die de ruïnes bewaken. Op onderzoeksniveau 3 kunnen spelers direct na het verlaten van de kamer met de put linksaf slaan en een slapende bij de deur vastleggen voor een eenvoudig fotoverzoek.
• Beheeyem – Beheeyem is op verschillende plaatsen in het hoofdgedeelte van de ruïnes te vinden. Een van de vele fotoverzoeken van het spel vereist dat spelers een foto maken van een die voorbij zweeft enkele ogenblikken nadat ze de Golurk hebben gewekt met de Natu op zijn schouder.
• Golurk – Er zijn talloze Golurk die de ruïnes bewaken. Als spelers er twee bij elkaar kunnen brengen op onderzoeksniveau 3, krijgen ze een geweldige fotomoment. Hierna kan men aan het begin van het parcours de ruïnes zien invliegen.
• Natu – Er zit een Natu op de schouder van de stilstaande Golurk die spelers moeten verplaatsen om bij de voorlaatste Crystabloom te komen. Op onderzoeksniveau 3 kan men via de buiteningang naar de ruïnes worden gelokt en een kleine groep van hen kan tussen twee van de standbeelden in de ruïnes worden geklikt.

Onderzoeksniveau 2

• Woobat – Als spelers een Fluffruit in de steenput gooien op onderzoeksniveau 2 of hoger, vliegt er een Woobat uit. Ze kunnen er maximaal vijf krijgen om op deze manier te verschijnen, maar uiteindelijk zal de Woobat niet meer komen. Als spelers er minstens één van loslaten, verschijnen ze op de centrale pilaar in het hoofdruïnegedeelte nadat ze op de muur zijn geland met de hartvormige markeringen bij de ingang.
• Magikarp – Nadat je vier of vijf Fluffruit in de put hebt gegooid, springt er een Magikarp uit in plaats van een Woobat.
• Chandelure – Er drijven een paar Chandelure rond in het gebied direct boven de ruïnes op onderzoeksniveau 2. Op onderzoeksniveau 3 is er een te vinden achter de speler op sommige treden terwijl ze naar beneden gaan naar het ruïnegedeelte en door er met een Illumina Orb op te slaan, vliegt het naar het einde van de cursus.
• Absol – Aanvankelijk verschijnt Absol alleen bij het altaar aan het einde van de cursus. Op onderzoeksniveau 3 kunnen spelers er echter een naar de buitenruimte lokken door de melodiespeler te gebruiken en vervolgens een Fluffruit naar links te gooien. Degene die in de ruïnes ligt, zal ook veel eerder verschijnen en een stuk dichter bij de NEO-ONE komen.

Onderzoeksniveau 3

• Umbreon – Onmiddellijk nadat spelers door het gat in de vloer zijn gegaan, zien ze een Noivern aan hun linkerkant. Als ze het raken met een Illumina Orb onmiddellijk nadat het de grond raakt, zal het wegvliegen en een Salandit zal verschijnen in de kleine doorgang. Door erop te slaan met een Illumina Orb zal het wegrennen en zal een Umbreon volgen. Het kan dan worden gevonden slapend op een van de standbeelden aan het einde van de cursus.
• Vivillon – Zoals gebruikelijk in Nieuwe Pokemon Snap, fladderen er een paar Vivillon rond aan het einde van de cursus zodra spelers onderzoeksniveau 3 hebben bereikt.

Einde spel

• Jirachi – Jirachi verschijnt zodra spelers het spel hebben voltooid en kan worden gevonden slapend op een stenen pilaar bij een van de standbeelden in de ruïnes. Het is mogelijk om hem wakker te maken met de Melody Player en Illumina Orbs en als je dit doet, verschijnt hij weer bij het altaar als spelers alle Crystablooms aansteken. Als je de Melody-speler hier eenmaal gebruikt, begint hij rond de gigantische lichtpilaar te vliegen en als je dit opnieuw doet, zal hij poseren voor zijn viersterrenfoto. Nadat het is toegevoegd aan de Photodex, zal het ook in het buitengebied verschijnen, hoewel spelers ervoor moeten zorgen dat ze het hier met een Illumina Orb raken als ze willen dat het later weer in de ruïnes verschijnt.